Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccser1Q8C0C4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms