Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms