Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c2Q8BL74 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms