Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nop53Q8BK35 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nop53Q8BK35 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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