Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbfox3Q8BIF2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms