Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Amigo1Q80ZD8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Amigo1Q80ZD8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Amigo1Q80ZD8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Amigo1Q80ZD8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Amigo1Q80ZD8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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