Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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