Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms