Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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