Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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