Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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