Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Dsg1bQ7TSF1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Dsg1bQ7TSF1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Dsg1bQ7TSF1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms