Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms