Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms