Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms