Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms