Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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