Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q6DFW0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q6DFW0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms