Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms