Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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