Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg9aQ68FE2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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