Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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