Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms