Protein–RNA interactions for Protein: Q61982

Notch3, Neurogenic locus notch homolog protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch3Q61982 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Notch3Q61982 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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