Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga6Q61739 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga6Q61739 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga6Q61739 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga6Q61739 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga6Q61739 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga6Q61739 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga6Q61739 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms