Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Mre11Q61216 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mre11Q61216 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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