Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms