Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms