Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Tdrd5Q5VCS6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tdrd5Q5VCS6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tdrd5Q5VCS6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tdrd5Q5VCS6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tdrd5Q5VCS6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms