Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms