Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.84□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms