Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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