Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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