Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.5 ms