Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms