Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 855.4 ms