Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm648Q3UJ22 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms