Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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