Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms