Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U595 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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