Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ulk3Q3U3Q1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ulk3Q3U3Q1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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