Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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