Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms