Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms