Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc10Q3TLI0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms