Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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