Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arhgap9Q1HDU4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arhgap9Q1HDU4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arhgap9Q1HDU4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Arhgap9Q1HDU4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms