Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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