Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms