Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms